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Lab-in-a-cell Biosensor als hochspezifischer Barcode-Reader |
| EGFP ist ein hell fluoreszierendes Protein und kann in zwei Untereinheiten gespalten werden (Split-EGFP). Diese sind nur dann fluoreszenzfähig, wenn beide einander räumlich genug nähern und die funktionelle Konformation einnehmen. Wir fusionieren je eine EGFP Split-Untereinheit an ein RNA bindendes CRISPR-Cas System (RNdCas). Die beiden RNdCas/gRNA Komplexe (Biosensor) detektieren SARS-CoV-2 schliesslich via komplementärer Basenpaarung der gRNA-Sonden und der SARS-CoV-2 mRNA (Barcode-Reader Prinzip). Nur bei optimalem Abstand der entsprechenden Sequenzabschnitte auf der SARS-CoV-2 mRNA findet eine EGFP Split-Complementation statt. Die zwei Komplementärpaarungen ermöglichen einen hochspezifischen Virusnachweis. |
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